客户信赖感差。消费者保健品知识不多,部分企业擅自更改保健食品说明书，混淆食品与药品的界限，鱼龙混珠，过渡透支行业信誉，且质量好坏难以分辨，让消费者失去信心。
公司、产品众多、竞争激烈。保健品审批相对药品简单，门槛低，大量非专业化企业涌入保健品行业，很多保健品依靠炒作迅速火爆，但其中隐藏着种种虚假、欺骗和误导消费者的不正当行为。
缺乏可持续性发展。我国保健食品大多为中小企业，产业集中度低，技术含量偏低，产品同质化严重，缺乏核心竞争力，没有专业的健康服务人才指导消费者食用保健品，也是保健品行业在发展中面临的人才瓶颈。
直销、会销、传销模式混杂，真假难辨。目前国家给予40个保健品企业直销牌照，而市场上保健品企业多如牛毛，从业人员素质参差不齐，缺乏一个合法的从业身份。
